159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3489 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3489  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 230 aa  456  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7072  putative transcriptional regulator, TetR family  64.42 
 
 		 216 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2597  transcriptional regulator, TetR family  60.58 
 
 		 218 aa  248  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127933  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3769  TetR family transcriptional regulator  57.94 
 
 		 235 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.396044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3842  TetR family transcriptional regulator  57.94 
 
 		 235 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3781  TetR family transcriptional regulator  57.94 
 
 		 235 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22730  transcriptional regulator, TetR family  59.15 
 
 		 216 aa  244  6.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1790  transcriptional regulator, TetR family  59.62 
 
 		 224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121253  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2416  TetR family transcriptional regulator  54.21 
 
 		 247 aa  228  8e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00485209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4236  TetR family transcriptional regulator  54.21 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1506  TetR family transcriptional regulator  56.22 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212096  hitchhiker  0.000526239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2891  transcriptional regulator, TetR family  54.98 
 
 		 236 aa  215  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2889  transcriptional regulator, TetR family  59.62 
 
 		 227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5743  regulatory protein TetR  39.88 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3894  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0466911 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2515  transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00143422  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4057  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2468  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3897  regulatory protein, TetR  34.15 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0396363  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3285  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  45.45 
 
 		 191 aa  62  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4548  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225011  normal  0.280375 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0301  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.593617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2515  regulatory protein, TetR  34.07 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.977555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0223  regulatory protein TetR  37.07 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.029073 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  33.81 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1768  regulatory protein, TetR  28.5 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  32.97 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 318 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 316 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 318 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 318 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 316 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 316 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 318 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 317 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5753  hypothetical protein  45 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3522  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  43.06 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  30.77 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 272 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 276 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0521  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.769368  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  35.06 
 
 		 207 aa  48.9  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 273 aa  48.5  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3294  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02639  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  40.32 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 220 aa  46.2  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  28.8 
 
 		 210 aa  46.2  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 295 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  46.88 
 
 		 204 aa  46.2  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  42.86 
 
 		 233 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  28.8 
 
 		 210 aa  46.2  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  42.86 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4065  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  42.65 
 
 		 221 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  28 
 
 		 227 aa  45.8  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 194 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>