More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3711 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  68.63 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 220 aa  95.5  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  32.21 
 
 		 227 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 213 aa  91.7  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 211 aa  91.3  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 211 aa  91.3  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 290 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  33.49 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 215 aa  89  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  30.77 
 
 		 213 aa  89  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  33.81 
 
 		 233 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  33.81 
 
 		 233 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0804  transcriptional regulator, TetR family  36.1 
 
 		 227 aa  85.1  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 317 aa  84.7  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 272 aa  84.7  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  43.01 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  33.01 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2069  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118237  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3595  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 313 aa  81.6  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 288 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 235 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3446  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  33.75 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  33.75 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  32.35 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  31.73 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  35.15 
 
 		 340 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0433  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.425009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02639  transcriptional regulator  30.82 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0418  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340149  hitchhiker  0.000146207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  29.11 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1789  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.461504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  34.13 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  31.65 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  34.02 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488249 
 
 
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NC_012880  Dd703_1814  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A2863  TetR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
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NC_013159  Svir_22730  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_7072  putative transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_2416  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 247 aa  62  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00485209  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_4236  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 236 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502121  normal  1 
 
 
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NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
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NC_007794  Saro_2468  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 255 aa  61.6  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
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NC_014210  Ndas_1790  transcriptional regulator, TetR family  56.67 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121253  normal  0.33193 
 
 
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NC_009921  Franean1_1506  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212096  hitchhiker  0.000526239 
 
 
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NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  47.27 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
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NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008688  Pden_4645  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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