More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1792 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7459  TetR family transcriptional regulator  72.88 
 
 		 233 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  72.61 
 
 		 227 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5610  hypothetical protein  76.15 
 
 		 238 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4645  TetR family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  31.53 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  31.53 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 234 aa  99  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 222 aa  97.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4015  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 231 aa  92.4  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 237 aa  92  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 290 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  31.68 
 
 		 205 aa  87.4  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  29.56 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
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NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0804  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  31.46 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
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NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 317 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0588  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  29.34 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02639  transcriptional regulator  25.96 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  26.32 
 
 		 214 aa  72  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  29.09 
 
 		 239 aa  72  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  26.83 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  27.44 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  30.3 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6888  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  36.11 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0433  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 354 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.425009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3595  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1814  transcriptional regulator, TetR family  26.64 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3446  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
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NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_0418  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340149  hitchhiker  0.000146207 
 
 
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NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_1789  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.461504  normal  1 
 
 
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NC_007963  Csal_2069  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118237  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal  1 
 
 
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NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  36.05 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
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NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
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NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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