More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3239 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  58.64 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3220  putative regulatory protein  65.94 
 
 		 145 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  48.17 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 211 aa  178  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  48.13 
 
 		 222 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  47 
 
 		 209 aa  177  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 222 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 222 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 195 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 196 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 208 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  45.06 
 
 		 203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  47.37 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 600 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0510  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.673095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  30.39 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  29.51 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2892  regulatory protein, TetR  50.88 
 
 		 635 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794047  normal  0.565465 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  32.06 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2470  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 187 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 224 aa  51.6  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 179 aa  51.6  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  41.67 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  41.89 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  41.67 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.34 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 245 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1189  regulatory protein TetR  31.18 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.34 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.34 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.34 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.34 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  33.6 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 230 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0925  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 165 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 308 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 187 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 326 aa  48.5  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 240 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>