More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3662 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  453  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  453  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  99.55 
 
 		 222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  83.85 
 
 		 202 aa  332  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  81.73 
 
 		 209 aa  327  6e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  56.15 
 
 		 223 aa  204  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 200 aa  175  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  47.94 
 
 		 211 aa  171  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 207 aa  168  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 209 aa  158  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 195 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 195 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 196 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 203 aa  148  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 210 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 208 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 208 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 208 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3220  putative regulatory protein  43.8 
 
 		 145 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  52.46 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1141  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  hitchhiker  0.000033846 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1189  regulatory protein TetR  31.25 
 
 		 195 aa  52.4  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 194 aa  52  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  28.23 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22730  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3493  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  29.79 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  34.55 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  35.8 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 275 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 190 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1665  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.271808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0588  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 276 aa  48.9  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1914  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000166268  normal  0.222991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 287 aa  48.9  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 167 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  29.84 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 228 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  31.17 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  42.59 
 
 		 191 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  35.16 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  29.03 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 600 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 275 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  38.82 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4015  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1252  regulatory protein, TetR  29.92 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.409819  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7072  putative transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 199 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1799  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  0.822653 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3493  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>