More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4293 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  70.43 
 
 		 211 aa  279  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  69.89 
 
 		 189 aa  273  9e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  57.98 
 
 		 201 aa  234  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  48.88 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  48.88 
 
 		 188 aa  177  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 188 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 188 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 188 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 188 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 188 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 188 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 197 aa  98.6  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 181 aa  94.7  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 187 aa  95.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 191 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  30.99 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 194 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  28.25 
 
 		 186 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  28.26 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 187 aa  92  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 193 aa  91.3  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 190 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  40.87 
 
 		 176 aa  90.9  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 195 aa  89.4  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 196 aa  88.6  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 196 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 600 aa  79  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 167 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  30.54 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  19.88 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  23.39 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 210 aa  52.4  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 287 aa  52  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  21.55 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 226 aa  51.2  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 224 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  35.38 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 224 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  21.55 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 232 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
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NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 215 aa  48.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
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NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
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NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 208 aa  48.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
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NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 206 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_0300  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000186865  n/a   
 
 
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NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 285 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
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NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 210 aa  47.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 193 aa  47.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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