More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2972 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  420  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  87.75 
 
 		 211 aa  370  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 223 aa  187  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 209 aa  185  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  47 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 209 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 222 aa  168  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 222 aa  168  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 195 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 195 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 196 aa  157  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 208 aa  154  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 195 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 208 aa  151  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 194 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 203 aa  140  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3220  putative regulatory protein  45.26 
 
 		 145 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3389  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  45.76 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1018  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2195  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2892  regulatory protein, TetR  44.29 
 
 		 635 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794047  normal  0.565465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 232 aa  52  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 226 aa  51.6  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0885  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 220 aa  51.2  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 193 aa  51.6  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  37.74 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1683  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2659  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144734  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  36.84 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 235 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 243 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1189  regulatory protein TetR  31.65 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 275 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 240 aa  48.9  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 233 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 268 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1904  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1710  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 233 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 233 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  33.98 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1382  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 217 aa  48.1  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 242 aa  48.1  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 223 aa  48.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2470  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1135  putative transcriptional regulator  30.91 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3475  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 275 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12440  AcrR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>