More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7851 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 165 aa  330  6e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  59.15 
 
 		 167 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 181 aa  140  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  39.41 
 
 		 176 aa  133  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  43.11 
 
 		 187 aa  124  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  44.25 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 179 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  103  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 198 aa  99.4  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 186 aa  98.2  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  35.09 
 
 		 187 aa  94  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 		 192 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 193 aa  91.3  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 189 aa  91.3  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 191 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  34.68 
 
 		 195 aa  90.9  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 194 aa  90.9  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 193 aa  90.9  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 191 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  32.95 
 
 		 186 aa  88.6  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  32.37 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 187 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  30.06 
 
 		 179 aa  85.5  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 195 aa  85.1  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 187 aa  84.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 193 aa  84.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 187 aa  84.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 187 aa  84.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 187 aa  84.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 191 aa  84  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
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NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 188 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  28.14 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 600 aa  71.6  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 189 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
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NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 198 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
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NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
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NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
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NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  28.66 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
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NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 208 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  40.54 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 225 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  27.17 
 
 		 196 aa  52.4  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 203 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 206 aa  52  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 207 aa  52  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 182 aa  52  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 207 aa  51.6  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 198 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  32.11 
 
 		 233 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 189 aa  51.2  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  29.32 
 
 		 200 aa  51.2  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 197 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  50.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 207 aa  50.8  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  28.46 
 
 		 200 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 200 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 208 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  32.11 
 
 		 233 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  36.76 
 
 		 207 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 218 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
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