More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0716 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  441  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  58.64 
 
 		 200 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  55 
 
 		 202 aa  210  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  51.57 
 
 		 222 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  51.12 
 
 		 222 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  51.12 
 
 		 222 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 209 aa  203  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 211 aa  191  9e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  52.6 
 
 		 195 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  52.6 
 
 		 195 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  53.51 
 
 		 196 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  53.41 
 
 		 194 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 206 aa  175  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  47.21 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  42.63 
 
 		 206 aa  165  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 209 aa  158  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 208 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 200 aa  155  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3220  putative regulatory protein  52.52 
 
 		 145 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  31.6 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 185 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2892  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 635 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794047  normal  0.565465 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 187 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 227 aa  52  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 240 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2659  transcriptional regulator, TetR family  23.9 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144734  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0925  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2470  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  32.26 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  42.65 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 232 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 232 aa  49.3  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 187 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 187 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4015  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 239 aa  48.9  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 600 aa  48.9  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 228 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 263 aa  48.5  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 239 aa  48.5  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  26.42 
 
 		 208 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  35.29 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  40.74 
 
 		 191 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1498  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.548232  normal  0.295378 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 186 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1189  regulatory protein TetR  29.63 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>