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for query gene Rmet_4188 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
211 aa  434  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  70.43 
 
 
188 aa  279  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  65.61 
 
 
189 aa  263  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
201 aa  231  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  50.86 
 
 
188 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  50.56 
 
 
188 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  50.56 
 
 
188 aa  175  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  49.44 
 
 
188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  49.44 
 
 
188 aa  171  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  49.44 
 
 
188 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  49.44 
 
 
188 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  48.31 
 
 
188 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  47.75 
 
 
188 aa  158  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 
193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 
193 aa  107  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  29.44 
 
 
186 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  30 
 
 
186 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 
192 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 
205 aa  91.3  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
600 aa  90.9  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 
193 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
187 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 
191 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  30.64 
 
 
189 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  31.58 
 
 
195 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
194 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  36.22 
 
 
179 aa  85.5  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
188 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
201 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 
189 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
187 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
197 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  32.52 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  33.08 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 
167 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 
165 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
191 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 
192 aa  60.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  23.75 
 
 
189 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 
192 aa  59.3  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  23.7 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 
202 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 
190 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 
212 aa  55.8  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
212 aa  55.8  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
200 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 
223 aa  55.1  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 
201 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2227  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 
194 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
226 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  22.45 
 
 
196 aa  52.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
215 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 
196 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 
185 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 
195 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  20.12 
 
 
195 aa  52  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
208 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
208 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
208 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
208 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 
212 aa  51.6  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  21.18 
 
 
189 aa  51.6  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  22.41 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3575  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
186 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  21.16 
 
 
198 aa  51.2  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
199 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
199 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal 
 
 
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NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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