271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3893 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  385  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1141  TetR family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 218 aa  188  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  hitchhiker  0.000033846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1252  regulatory protein, TetR  52.75 
 
 		 201 aa  164  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.409819  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 190 aa  159  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0925  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0410  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 414 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1705  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2036  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 232 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  31.38 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  27.87 
 
 		 186 aa  51.6  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 222 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 182 aa  51.2  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2089  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.850407  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 278 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 278 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 278 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2015  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.997895  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.57 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  28.57 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  31.08 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 212 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 199 aa  48.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 178 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 277 aa  47.8  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 275 aa  47.8  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 195 aa  47.8  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4271  regulatory protein TetR  30.27 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.484179  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  31.19 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  24.71 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 275 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 477 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 477 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  27.91 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  29.31 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 207 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 237 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 221 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  25 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3395  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.584176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>