More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7097 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  62.05 
 
 		 210 aa  248  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  52.2 
 
 		 208 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  51.71 
 
 		 208 aa  205  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  51.71 
 
 		 208 aa  205  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  48.69 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 208 aa  197  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 200 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 223 aa  175  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 202 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 222 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 222 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 200 aa  138  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 195 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 195 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3220  putative regulatory protein  41.48 
 
 		 145 aa  101  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0290  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547414  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0304  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0925  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 187 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  44.83 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 187 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 187 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 188 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 188 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 318 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 316 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 429 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 317 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 318 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 273 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 273 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 273 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 318 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 318 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 316 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 316 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  35.71 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2128  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.544484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  36.54 
 
 		 246 aa  49.3  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 299 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 165 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 167 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 287 aa  48.9  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0161  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1141  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  hitchhiker  0.000033846 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  43.64 
 
 		 186 aa  48.9  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 272 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 276 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  43.28 
 
 		 326 aa  48.5  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 221 aa  48.5  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 231 aa  48.1  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>