More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4909 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  57.98 
 
 		 188 aa  234  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 211 aa  231  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  58.6 
 
 		 189 aa  229  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  49.71 
 
 		 188 aa  170  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 188 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 188 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 188 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 188 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 188 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 193 aa  91.7  7e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  28.57 
 
 		 186 aa  89  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 192 aa  89  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 201 aa  88.2  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  29.14 
 
 		 186 aa  88.2  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 181 aa  88.2  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 190 aa  84.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  29.27 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  33.08 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  27.33 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 600 aa  73.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  29.94 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  26.8 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  30.7 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  20.97 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  34.86 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3099  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_0300  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000186865  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 224 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
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NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  23.12 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
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