More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2181 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 189 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  79.66 
 
 		 197 aa  271  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2128  TetR family transcriptional regulator  78.07 
 
 		 201 aa  261  4.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.544484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2332  regulatory protein, TetR  46.82 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376775  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  42.71 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  39.42 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  36.56 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 		 287 aa  54.7  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  21.55 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 234 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 234 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 231 aa  52.8  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  31.31 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1392  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  55.32 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 227 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  43.18 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 226 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  44.83 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 224 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1480  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 235 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1502  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 235 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 195 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 209 aa  51.2  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 195 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 200 aa  51.2  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 295 aa  51.6  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 195 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 288 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 230 aa  51.2  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 209 aa  51.2  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>