More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3421 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  421  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 228 aa  111  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0161  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3099  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 222 aa  95.1  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296713  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 285 aa  89.4  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1498  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.548232  normal  0.295378 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6862  TetR family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000147849  normal  0.19991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  22.64 
 
 		 510 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  22.63 
 
 		 477 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  22.63 
 
 		 477 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  23.75 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0743  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 230 aa  52  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.803231 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  22.83 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 245 aa  51.6  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 186 aa  51.6  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5867  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0832592  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  25.18 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  26.67 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  25.18 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6843  TetR family transcriptional regulator  21.84 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163651  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  34.62 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 189 aa  48.5  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 216 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 400 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 189 aa  48.1  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 201 aa  48.1  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 247 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0959  TetR family transcriptional regulator  19.05 
 
 		 225 aa  48.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0771  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.353788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  25.95 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0339  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1805  hypothetical protein  23.31 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  20.39 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2010  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.267977  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  21.28 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1067  TetR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 167 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  22.1 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>