More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2518 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  92.93 
 
 		 202 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  81.73 
 
 		 222 aa  327  6e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  81.73 
 
 		 222 aa  327  6e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  81.73 
 
 		 222 aa  326  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  53.93 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  47 
 
 		 200 aa  177  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 211 aa  175  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 207 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 209 aa  154  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 206 aa  150  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 196 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 194 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3220  putative regulatory protein  43.07 
 
 		 145 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  50.82 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 185 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1189  regulatory protein TetR  32.5 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3451  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4015  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3493  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0588  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 276 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  35.8 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3254  transcriptional regulator, TetR family  22.44 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1665  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.271808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0681  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  30.99 
 
 		 258 aa  48.9  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  28.23 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  40.35 
 
 		 191 aa  48.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 225 aa  48.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1914  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  48.1  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000166268  normal  0.222991 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 227 aa  48.5  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 242 aa  48.1  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2824  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  39.47 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0410  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  41.54 
 
 		 340 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3831  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.484216  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  32.88 
 
 		 237 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  36.05 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  37.25 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  34.07 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 295 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3595  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 313 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3493  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>