More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5169 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  85.2 
 
 		 194 aa  331  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  75.53 
 
 		 195 aa  293  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  75.53 
 
 		 195 aa  293  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  76.06 
 
 		 195 aa  278  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  53.51 
 
 		 223 aa  181  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 200 aa  161  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 207 aa  157  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 211 aa  157  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 222 aa  148  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 209 aa  145  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 202 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 206 aa  127  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 200 aa  124  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 210 aa  121  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3220  putative regulatory protein  45.45 
 
 		 145 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  37.04 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 287 aa  58.2  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2892  regulatory protein, TetR  32.41 
 
 		 635 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794047  normal  0.565465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2470  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  32 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 227 aa  52.8  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  32.81 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  32.94 
 
 		 212 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 226 aa  51.2  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 206 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  29.53 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  34.67 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  34.11 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 232 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0510  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.673095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  28.81 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  45 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1678  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 216 aa  48.9  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 242 aa  48.9  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  30.38 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 225 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 232 aa  48.9  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  33.88 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 225 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 226 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 243 aa  48.5  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  36.46 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 226 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 184 aa  48.5  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 239 aa  48.1  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 226 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 212 aa  48.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 231 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  37.88 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 226 aa  48.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>