More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4359 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
205 aa  410  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  54.14 
 
 
202 aa  171  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  47.57 
 
 
199 aa  147  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
191 aa  134  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 
192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  43.5 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  43.5 
 
 
217 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 
176 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 
204 aa  108  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
200 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
200 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
200 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
197 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 
210 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  39.34 
 
 
204 aa  101  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 
224 aa  100  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  37.87 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 
212 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 
208 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 
201 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 
208 aa  92  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  36.47 
 
 
191 aa  91.3  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
383 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
192 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
216 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
216 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
216 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
231 aa  87  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
194 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
193 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
194 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 
194 aa  82  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 
193 aa  81.3  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
195 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 
204 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 
230 aa  79  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 
202 aa  79  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 
200 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  29.55 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 
182 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4255  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
189 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  26.49 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  32.3 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 
231 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  34.32 
 
 
189 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  34.32 
 
 
189 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 
185 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  29.28 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
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NC_009338  Mflv_1535  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  29.9 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
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NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
287 aa  68.2  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000686866 
 
 
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NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
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NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
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