273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0925 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0925  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  26.55 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3570  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3643  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.664525  normal  0.339834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3575  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  29.73 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  23.53 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  22.75 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  27.75 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  43.24 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  28.32 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3867  putative transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000371985  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3054  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 126 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108952 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2752  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3785  hypothetical protein  27.01 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 276 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 275 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1710  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  31.75 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  28.24 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  28.24 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  28.24 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  28.24 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 272 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 275 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 285 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0161  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  28.24 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  32.76 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  24.08 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  28.24 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  32.89 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  31.37 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  35.06 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 87 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 258 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  32.79 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 273 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  25.29 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  25.29 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 273 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  25.29 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 273 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 231 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  37.68 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 283 aa  45.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 181 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 222 aa  45.1  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>