More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4140 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  411  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  92.93 
 
 		 209 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  84.38 
 
 		 222 aa  335  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  83.85 
 
 		 222 aa  332  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  83.85 
 
 		 222 aa  332  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  56.02 
 
 		 223 aa  209  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  48.17 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  47 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 206 aa  164  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 209 aa  158  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 203 aa  151  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 196 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 210 aa  144  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 200 aa  144  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 208 aa  128  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3220  putative regulatory protein  45.99 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  50.82 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  31.58 
 
 		 258 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1189  regulatory protein TetR  32.5 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 190 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3493  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  36.26 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4015  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  35.11 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0588  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1665  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.271808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  28.23 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 189 aa  48.9  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2129  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1965  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1914  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000166268  normal  0.222991 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3451  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  39.74 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  40.35 
 
 		 191 aa  48.5  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 227 aa  48.1  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  28.9 
 
 		 238 aa  48.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  42.86 
 
 		 340 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0410  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  35.38 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3493  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 242 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 295 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3595  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 313 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 229 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 287 aa  45.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 273 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 226 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 226 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0681  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 226 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>