More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0681 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 167 aa  330  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  59.15 
 
 		 165 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  39.39 
 
 		 176 aa  134  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 181 aa  130  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 197 aa  117  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 190 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 187 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 196 aa  94.7  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 193 aa  88.2  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 188 aa  87.8  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 191 aa  87.8  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 198 aa  87  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 191 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  31.43 
 
 		 186 aa  85.1  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 193 aa  84.7  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  35.06 
 
 		 187 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  29.71 
 
 		 186 aa  84.3  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  35.16 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  29.87 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 205 aa  80.9  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  28.82 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 600 aa  75.1  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 196 aa  73.9  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 193 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 192 aa  67.4  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 198 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  26.62 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 220 aa  54.3  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0940  transcriptional regulator  31.76 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00130273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 238 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 225 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  40.62 
 
 		 207 aa  52.4  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 212 aa  52  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 237 aa  52  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  28.79 
 
 		 200 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 200 aa  50.8  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 203 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  39.71 
 
 		 227 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  42.19 
 
 		 214 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 206 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 212 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 224 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 204 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 228 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  42.19 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 287 aa  48.9  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 228 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 212 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
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NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 212 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 228 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
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NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 212 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 213 aa  48.5  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 222 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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