More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2297 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  394  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  60.33 
 
 		 196 aa  222  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  55.43 
 
 		 193 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  53.37 
 
 		 195 aa  198  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 201 aa  195  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 193 aa  108  5e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 188 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 194 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  34.05 
 
 		 195 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 193 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 186 aa  95.5  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  32.97 
 
 		 187 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  29.12 
 
 		 186 aa  92  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 189 aa  91.7  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  29.12 
 
 		 186 aa  90.9  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 165 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 211 aa  88.2  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  27.68 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  28.49 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  23.36 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  25.77 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 600 aa  58.5  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  21.71 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
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NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  35.44 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  26.21 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
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NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 213 aa  48.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 198 aa  48.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 183 aa  47.8  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
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NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  23.86 
 
 		 200 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009523  RoseRS_1070  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 229 aa  47.8  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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