179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4685 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 189 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  30.18 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 600 aa  85.1  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  31.07 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 185 aa  84.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  30.51 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 188 aa  72  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 188 aa  72  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  24.28 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  28.32 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 167 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  28.19 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  31.4 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  21.51 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  20.86 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  20.97 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  21.82 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0300  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000186865  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  19.88 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 181 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  21.18 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 183 aa  51.2  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
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NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  21.69 
 
 		 199 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  20.83 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.8 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
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NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
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NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
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NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  22.67 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  23.49 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
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NC_007912  Sde_3722  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 189 aa  48.5  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  28.12 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
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NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  19.58 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
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NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  21.28 
 
 		 199 aa  48.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_0676  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 191 aa  48.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
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NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  22.42 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  19.08 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
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NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  29.52 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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