More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4614 on replicon NC_013167
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 191 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  65.97 
 
 		 195 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  26.7 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  25 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  25.14 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  25 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  24.71 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 600 aa  67.4  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  24.14 
 
 		 186 aa  67  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  22.47 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  21.35 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  21.14 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  20.77 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  23.53 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  23.32 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  30.09 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  23.73 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  19.37 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  25.71 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  22.35 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5412  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00435132  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  28.85 
 
 		 280 aa  55.1  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  29.1 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 310 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  31.31 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  27.46 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 228 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  22.47 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>