More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3547 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 187 aa  250  8.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  62.3 
 
 		 196 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  60.33 
 
 		 191 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  59.78 
 
 		 191 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 190 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 179 aa  156  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 181 aa  111  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  35.06 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  29.48 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  34.73 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  35.93 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 193 aa  98.2  6e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 196 aa  97.4  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 165 aa  94  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 186 aa  90.9  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 205 aa  90.5  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 187 aa  88.6  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 187 aa  88.2  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 187 aa  88.2  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
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NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 188 aa  87.8  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 216 aa  85.1  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 167 aa  84.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  31.65 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 600 aa  82.4  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 188 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  24.86 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  25.19 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  22.95 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  25.63 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  22.46 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 189 aa  51.2  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 189 aa  51.2  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
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NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010571  Oter_3816  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0181155  normal  0.234249 
 
 
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NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 223 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  46 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  33.33 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
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NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
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NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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