More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0424 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 188 aa  378  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  76.6 
 
 		 198 aa  290  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  43.98 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  42.86 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  42.77 
 
 		 194 aa  117  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  39.16 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 205 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 187 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  29.89 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 187 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  32.34 
 
 		 189 aa  98.2  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 187 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 192 aa  95.9  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 187 aa  94.4  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 198 aa  89.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 179 aa  89  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 216 aa  89  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 167 aa  87.8  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 187 aa  84.7  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  27.13 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  27.68 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 600 aa  72  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  25.93 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  27.53 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  25.69 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  23.48 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  21.05 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  45 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  29.12 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 291 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  22.87 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 207 aa  52  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 388 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 197 aa  51.6  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  51.2  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2508  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 206 aa  51.2  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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