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for query gene Bamb_1980 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  383  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  67.03 
 
 		 187 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  61.5 
 
 		 187 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  60.96 
 
 		 187 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  60.96 
 
 		 187 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  59.89 
 
 		 187 aa  237  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  59.36 
 
 		 187 aa  216  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  53.11 
 
 		 196 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  41.99 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  44.71 
 
 		 189 aa  147  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  40.37 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  40.74 
 
 		 195 aa  124  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 194 aa  124  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 191 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 197 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 201 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 188 aa  101  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 600 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 198 aa  98.2  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 188 aa  98.2  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 188 aa  97.8  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 188 aa  97.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 189 aa  95.5  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 185 aa  94.7  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 193 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 187 aa  91.3  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  31.9 
 
 		 186 aa  91.3  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  32.47 
 
 		 189 aa  90.9  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  32.35 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 196 aa  88.6  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 192 aa  88.2  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 211 aa  87.8  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  30 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 165 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 195 aa  84.7  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 196 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  31.34 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  27.5 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0300  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000186865  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 199 aa  64.3  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  24.57 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  24.65 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
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NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  21.55 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 310 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  29.28 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
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NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
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