More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0335 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  392  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 200 aa  128  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 199 aa  123  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  38.51 
 
 		 227 aa  97.1  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3816  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0181155  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 193 aa  94.4  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 193 aa  91.3  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 194 aa  89.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 221 aa  88.6  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  30.36 
 
 		 198 aa  88.2  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 196 aa  85.5  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 199 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 211 aa  85.1  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 219 aa  84.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 202 aa  84.7  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 220 aa  84.7  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  36.14 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  31.05 
 
 		 220 aa  77.8  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  30.65 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  25.38 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 222 aa  72  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  28.5 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5102  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  26.67 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 199 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 199 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 199 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
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NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  19.27 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
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CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
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NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
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NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
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