More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0809 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 214 aa  430  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  65.59 
 
 		 212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  59.61 
 
 		 212 aa  251  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  62.93 
 
 		 211 aa  251  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  63.69 
 
 		 179 aa  244  6.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  61.29 
 
 		 219 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  54.33 
 
 		 213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  63.83 
 
 		 212 aa  241  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  60.64 
 
 		 209 aa  239  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 210 aa  237  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  62.77 
 
 		 212 aa  235  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  62.77 
 
 		 212 aa  235  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  62.77 
 
 		 212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 186 aa  231  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 186 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  51.18 
 
 		 222 aa  227  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  53.43 
 
 		 210 aa  226  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  58.85 
 
 		 204 aa  223  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  54.81 
 
 		 219 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 220 aa  204  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  58.28 
 
 		 162 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 207 aa  188  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  53.16 
 
 		 227 aa  188  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  44.15 
 
 		 215 aa  175  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  44.15 
 
 		 196 aa  168  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 196 aa  161  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  40.44 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 193 aa  155  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  38.3 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 221 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
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NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  42.29 
 
 		 192 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  39.46 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 200 aa  108  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  35.56 
 
 		 196 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  34.64 
 
 		 196 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
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NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
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NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 201 aa  99.8  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 194 aa  99  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
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NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  98.6  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  34.29 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
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NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 190 aa  96.3  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 194 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
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NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 197 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  33.71 
 
 		 194 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  31.28 
 
 		 194 aa  92  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 199 aa  89.4  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 199 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 193 aa  89  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 199 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 199 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 199 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  34.22 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 190 aa  85.9  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  31.98 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  29.78 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_0016  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.951687  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0261  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036521 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3760  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_0262  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_4468  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  29.14 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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