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for query gene MCA0316 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
176 aa  363  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  56.82 
 
 
202 aa  226  9e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  38.01 
 
 
212 aa  123  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
210 aa  117  7.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  39.08 
 
 
219 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  35.63 
 
 
198 aa  114  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  39.75 
 
 
205 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
212 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  38.15 
 
 
211 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 
190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
186 aa  111  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
212 aa  111  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  39.75 
 
 
192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  37.65 
 
 
222 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 
212 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 
196 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 
213 aa  106  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
186 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
196 aa  104  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
212 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
212 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
215 aa  104  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 
214 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 
196 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 
206 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 
179 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
211 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 
206 aa  99.8  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 
193 aa  99  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
220 aa  99  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
206 aa  98.6  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  33.33 
 
 
209 aa  97.8  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
190 aa  97.8  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 
196 aa  97.8  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  34.15 
 
 
200 aa  97.4  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 
206 aa  97.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 
206 aa  97.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 
206 aa  97.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 
209 aa  97.1  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  35.12 
 
 
219 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
206 aa  96.3  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
219 aa  95.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
193 aa  94.4  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 
204 aa  94  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
206 aa  93.6  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
194 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
210 aa  92  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  34.46 
 
 
194 aa  92.4  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
200 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
202 aa  92  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0016  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
206 aa  91.7  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.951687  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
201 aa  91.3  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
200 aa  91.3  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
207 aa  90.9  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 
227 aa  90.9  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
206 aa  90.5  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 
191 aa  89.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
199 aa  89  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
199 aa  89  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
199 aa  89  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  31.98 
 
 
194 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
196 aa  88.6  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
193 aa  87.8  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  32.32 
 
 
199 aa  87.8  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
196 aa  87.4  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
212 aa  86.3  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 
198 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 
222 aa  85.5  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
214 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  30.67 
 
 
193 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 
209 aa  84.3  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
194 aa  84.3  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
197 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  28.66 
 
 
209 aa  81.3  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  31.06 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  31.06 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  32.03 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
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NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal 
 
 
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NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
247 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
199 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal 
 
 
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NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
311 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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