More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_25370 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  100 
 
 		 209 aa  428  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  59.81 
 
 		 222 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  69.83 
 
 		 179 aa  262  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  60.71 
 
 		 219 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  59.52 
 
 		 210 aa  258  4e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  58.94 
 
 		 214 aa  252  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  56.91 
 
 		 212 aa  231  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 211 aa  230  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  57.51 
 
 		 212 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  57.51 
 
 		 212 aa  225  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  59.34 
 
 		 186 aa  224  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 213 aa  223  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  56.99 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  56.99 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  51.21 
 
 		 212 aa  222  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  58.24 
 
 		 186 aa  221  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 220 aa  219  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  55.73 
 
 		 204 aa  207  9e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  48.36 
 
 		 207 aa  203  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  60.78 
 
 		 162 aa  201  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  48.34 
 
 		 219 aa  181  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  47.12 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 215 aa  156  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  41.44 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 193 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  37.5 
 
 		 198 aa  138  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 205 aa  121  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 196 aa  104  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  35.33 
 
 		 196 aa  101  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 190 aa  101  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 202 aa  99.4  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 196 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 176 aa  97.8  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  32.2 
 
 		 200 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 194 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  33.69 
 
 		 194 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 190 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 193 aa  88.6  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 194 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 199 aa  87.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  29.67 
 
 		 195 aa  85.5  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 247 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 197 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0016  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 206 aa  85.1  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.951687  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 199 aa  84.7  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
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NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
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NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  30.72 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  30.54 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  28.98 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
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