More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2209 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  417  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  376  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  55.15 
 
 		 213 aa  205  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  47.94 
 
 		 205 aa  187  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1410  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 194 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 196 aa  124  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  28.93 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  31.43 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  30.06 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  28.72 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  32.18 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 209 aa  71.2  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  27.89 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  24.64 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1764  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0265729  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
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NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  28.31 
 
 		 219 aa  62  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  26.04 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0706  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  20.93 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  31.58 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.87 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
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NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
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NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  29.81 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  28.02 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_0020  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.390674  normal  0.0209926 
 
 
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NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  26.83 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
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NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
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NC_013131  Caci_7134  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0109323  normal  0.572193 
 
 
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NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  27.74 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
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NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  26.96 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
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NC_009831  Ssed_3643  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256948 
 
 
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NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  21.72 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
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