26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1764 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1764  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  400  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0265729  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  25.81 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2686  regulatory protein TetR  23.03 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2781  regulatory protein TetR  21.35 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.83276  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 205 aa  42  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 233 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1081  HTH-type transcriptional regulator RutR  24.32 
 
 		 212 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1186  HTH-type transcriptional regulator RutR  24.32 
 
 		 212 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1231  HTH-type transcriptional regulator RutR  24.32 
 
 		 212 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1817  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 195 aa  41.6  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 201 aa  41.6  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  24.32 
 
 		 212 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 207 aa  41.6  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 198 aa  41.2  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>