More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1935 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 233 aa  460  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  58.01 
 
 		 204 aa  208  6e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  45.56 
 
 		 199 aa  152  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  43.37 
 
 		 269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 		 194 aa  128  9.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  43.83 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  39.23 
 
 		 200 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  44.17 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3888  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 		 207 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2919  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0416345  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 		 209 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4340  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0499  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 201 aa  102  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1196  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000002147  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 203 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  28.8 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22250  transcriptional regulator  26.9 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0446991  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  23.39 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  21.25 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  20.62 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 199 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 190 aa  52.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 188 aa  52.4  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 195 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  22.28 
 
 		 198 aa  52.4  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  20.51 
 
 		 200 aa  52.4  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  19.62 
 
 		 188 aa  52  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 208 aa  52  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 242 aa  52  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  20 
 
 		 188 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 195 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  30.14 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  19.62 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1492  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0811  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.646976  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 189 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2925  regulatory protein TetR  25.64 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  25.35 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0503  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0455  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 193 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0937341  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 197 aa  49.3  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 181 aa  48.9  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5327  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 219 aa  48.9  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2564  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 214 aa  48.9  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.454515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 202 aa  48.9  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 192 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5412  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00435132  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 208 aa  48.9  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 196 aa  48.5  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>