More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1940 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  398  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 201 aa  214  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 199 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 195 aa  153  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  33.69 
 
 		 196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3140  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 196 aa  135  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.404836  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 196 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 196 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3234  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 196 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3487  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 196 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.418737  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3462  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 196 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00233938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3448  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B3453  transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 		 196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0161587  hitchhiker  4.69207e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 		 196 aa  132  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0042  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 196 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  38.25 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
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NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 195 aa  122  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
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NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
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NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5582  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
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NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
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NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  32.12 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  28.79 
 
 		 220 aa  72  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  28.09 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  31.64 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  23.76 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  30.16 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 198 aa  67.8  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  20.97 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 199 aa  67.8  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  29.78 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1410  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
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NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  28.64 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
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