More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4358 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 220 aa  442  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  93.33 
 
 		 223 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  46.08 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7134  transcriptional regulator, TetR family  42.6 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0109323  normal  0.572193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3489  transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 		 200 aa  122  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0892  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0875  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0881  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4594  TetR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0891  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0874  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0880  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 194 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 195 aa  88.2  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  27.89 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  29.19 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 198 aa  72  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  25.37 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  24.23 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  32.56 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  24.37 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  23.37 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 186 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  20.35 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  26.94 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  21.74 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  22.63 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5058  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  49.28 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  22.99 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>