More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4138 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
203 aa  425  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal 
 
 
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NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 
196 aa  202  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
213 aa  102  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
220 aa  88.6  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1410  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  29.27 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  23.95 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  23.59 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  22.89 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 
214 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  25.88 
 
 
198 aa  64.3  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 
198 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  26.55 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 
197 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
195 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 
214 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  25 
 
 
196 aa  62.8  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 
196 aa  62  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 
213 aa  61.6  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  23.95 
 
 
219 aa  61.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 
212 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 
212 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  22.56 
 
 
197 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  27.49 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  21.89 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 
190 aa  59.7  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0020  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 
246 aa  59.7  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.390674  normal  0.0209926 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 
222 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 
198 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  21.11 
 
 
198 aa  59.3  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
216 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
216 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 
209 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
216 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 
198 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 
206 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
190 aa  58.2  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
191 aa  58.2  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0985  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 
222 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 
223 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3196  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
293 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.431019  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  25.85 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  23.86 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1392  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.637203  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1617  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2643  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
304 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2118  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 
219 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  26.79 
 
 
196 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2503  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 
206 aa  56.6  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2556  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
304 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
202 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2299  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
201 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633617  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  23.38 
 
 
197 aa  56.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  21.47 
 
 
186 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
192 aa  56.6  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 
175 aa  55.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  24.72 
 
 
200 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0261  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 
198 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3760  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 
198 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  24.28 
 
 
195 aa  55.8  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 
201 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 
209 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
198 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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