More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7205 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 188 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  65.93 
 
 		 196 aa  235  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  45.11 
 
 		 201 aa  164  9e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 183 aa  161  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  41.99 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 194 aa  72  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 194 aa  72  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 191 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5582  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  26.54 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 198 aa  64.3  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3212  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  27.62 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  24.28 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  28.39 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3140  TetR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.404836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3816  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0181155  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  29.76 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1841  transcriptional regulator, TetR family protein  24.87 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  23.4 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3234  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3487  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.418737  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3462  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00233938  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3448  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  26.7 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  27.13 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0042  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B3453  transcriptional regulator, TetR family  22.87 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0161587  hitchhiker  4.69207e-17 
 
 
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NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
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NC_007969  Pcryo_0969  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021423 
 
 
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NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
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NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
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NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
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NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 297 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  32.1 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
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NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
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NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
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NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
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NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
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