More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5096 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 195 aa  159  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 196 aa  152  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  38.34 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 199 aa  131  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 		 194 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  37.71 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5582  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  30.11 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3448  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3234  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3487  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.418737  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3462  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00233938  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 196 aa  92  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3453  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 196 aa  91.3  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0161587  hitchhiker  4.69207e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3140  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.404836  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0042  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  27.47 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  25.13 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  24.47 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 179 aa  67.8  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  22.4 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
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NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_2409  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007651  BTH_I0563  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
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