More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2862 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  416  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  52.33 
 
 		 200 aa  209  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 198 aa  204  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  48.69 
 
 		 194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 196 aa  181  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5582  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 198 aa  141  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0042  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 196 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3140  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.404836  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3453  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0161587  hitchhiker  4.69207e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 196 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3234  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3487  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.418737  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3448  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3462  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00233938  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  28.95 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_3948  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  20.96 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4669  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  26.47 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3099  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0420  TetR family regulatory protein  22.09 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2508  transcriptional regulator, TetR family  22.01 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  21.88 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6800  putative transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  22.51 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
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NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  22.42 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
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NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_1225  TetR family transcriptional regulator  20.36 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
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NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_0178  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  1 
 
 
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NC_008390  Bamb_1519  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  23.27 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_1542  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  25.77 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
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NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
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NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  21.82 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
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NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
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NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
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