More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2314 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 213 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  72.16 
 
 		 199 aa  279  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 196 aa  111  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1307  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 202 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 205 aa  104  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  36.69 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3302  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.696216 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 202 aa  99.4  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 202 aa  99  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 202 aa  97.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 202 aa  96.3  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 197 aa  94.7  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 200 aa  92  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1240  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 201 aa  91.3  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3254  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2985  nucleoid occlusion protein  29.59 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.111899  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1915  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  27.06 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000140669 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  27.66 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000410739  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  27.66 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3773  nucleoid occlusion protein  24.73 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.461125 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4251  nucleoid occlusion protein  24.73 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0182  nucleoid occlusion protein  24.87 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847466  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3622  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0399  nucleoid occlusion protein  24.19 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0627309  hitchhiker  0.000000000130483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0374  nucleoid occlusion protein  24.19 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0373  nucleoid occlusion protein  24.19 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0485263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0385  nucleoid occlusion protein  24.19 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000224895  hitchhiker  0.00861349 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  27.27 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3600  nucleoid occlusion protein  24.73 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.741133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0356  nucleoid occlusion protein  24.73 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3674  nucleoid occlusion protein  27.68 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00408157  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  28.95 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0459  nucleoid occlusion protein  24.19 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126678  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2484  nucleoid occlusion protein  23.96 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.11022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3098  nucleoid occlusion protein  23.96 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170288  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6449  nucleoid occlusion protein  24.35 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3114  nucleoid occlusion protein  23.83 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2257  nucleoid occlusion protein  24.85 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.178912  hitchhiker  0.0000216309 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4564  nucleoid occlusion protein  26.79 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000269162  unclonable  0.0000000294752 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0194  nucleoid occlusion protein  26.06 
 
 		 196 aa  72  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2389  nucleoid occlusion protein  26.6 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.102395  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3502  nucleoid occlusion protein  27.27 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.284468  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2012  nucleoid occlusion protein  25.81 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0627  nucleoid occlusion protein  22.89 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.375777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0382  nucleoid occlusion protein  25.81 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000135011  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0155  nucleoid occlusion protein  27.69 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.894699  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0059  nucleoid occlusion protein  23.44 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0445493  normal  0.11202 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0031  nucleoid occlusion protein  25.86 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3963  nucleoid occlusion protein  30.65 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000172432  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4158  nucleoid occlusion protein  28.21 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000407134  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0052  nucleoid occlusion protein  28.21 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.881528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0777  nucleoid occlusion protein  26.7 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0058  nucleoid occlusion protein  28.21 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00579463  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4393  nucleoid occlusion protein  28.21 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000163426  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4845  nucleoid occlusion protein  28.21 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111456  decreased coverage  0.000000677674 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1729  nucleoid occlusion protein  26.04 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0324  nucleoid occlusion protein  24.23 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03498  nucleoid occlusion protein  27.18 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0113918  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0064  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000175826  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5011  nucleoid occlusion protein  27.18 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0450587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4142  nucleoid occlusion protein  27.18 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000526151  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4066  nucleoid occlusion protein  27.18 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00270158  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03450  hypothetical protein  27.18 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00837733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0070  nucleoid occlusion protein  27.18 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000194925  unclonable  0.00000000943905 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3850  nucleoid occlusion protein  27.18 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4119  nucleoid occlusion protein  26.67 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4058  nucleoid occlusion protein  26.67 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4012  nucleoid occlusion protein  26.67 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.554445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3931  nucleoid occlusion protein  26.67 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0886736  hitchhiker  0.000487739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3949  nucleoid occlusion protein  26.67 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1117  nucleoid occlusion protein  23.93 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.862438  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3976  nucleoid occlusion protein  27.18 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.027184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4103  nucleoid occlusion protein  28.21 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0313607  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0098  nucleoid occlusion protein  26.67 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0100985  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>