More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0832 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  396  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  65.82 
 
 		 196 aa  277  9e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  67.18 
 
 		 205 aa  273  9e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  67.01 
 
 		 195 aa  272  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 196 aa  239  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 203 aa  191  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 200 aa  147  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 197 aa  114  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 202 aa  87.8  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  22.84 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1334  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1240  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1307  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1915  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3502  nucleoid occlusion protein  28 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.284468  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  24.37 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000410739  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3302  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.696216 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3622  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4158  nucleoid occlusion protein  29.61 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000407134  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  26.71 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  27.46 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0058  nucleoid occlusion protein  29.61 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00579463  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0052  nucleoid occlusion protein  29.61 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.881528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  27.04 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  27.04 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4103  nucleoid occlusion protein  29.61 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0313607  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2389  nucleoid occlusion protein  30.25 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.102395  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3254  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4393  nucleoid occlusion protein  28.95 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000163426  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3674  nucleoid occlusion protein  24.67 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00408157  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  24.35 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1436  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.940915  normal  0.193535 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4602  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.904797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  33.66 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0059  nucleoid occlusion protein  25.81 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0445493  normal  0.11202 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0155  nucleoid occlusion protein  27.92 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.894699  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  25.66 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  22.78 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00047  nucleoid occlusion protein  24.21 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0385  nucleoid occlusion protein  25.53 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000224895  hitchhiker  0.00861349 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0399  nucleoid occlusion protein  25.53 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0627309  hitchhiker  0.000000000130483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0374  nucleoid occlusion protein  25.53 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0373  nucleoid occlusion protein  25.53 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0485263  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4845  nucleoid occlusion protein  28.29 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111456  decreased coverage  0.000000677674 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3963  nucleoid occlusion protein  27.63 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000172432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>