246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3094 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
212 aa  435  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  44.09 
 
 
203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1915  transcriptional regulator, TetR family  43.23 
 
 
200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
202 aa  178  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
202 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
202 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
202 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
202 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  41.15 
 
 
202 aa  175  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
212 aa  174  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1307  transcriptional regulator, TetR family  44.15 
 
 
202 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1240  TetR family transcriptional regulator  43.09 
 
 
201 aa  170  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  41.21 
 
 
202 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 
202 aa  160  9e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 
202 aa  158  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 
202 aa  153  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 
202 aa  152  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  39.01 
 
 
199 aa  150  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 
202 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3622  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  44.51 
 
 
201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3254  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
199 aa  145  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
201 aa  141  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1362  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
139 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2838  hypothetical protein  44.86 
 
 
186 aa  102  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209272 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 
213 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 
199 aa  84  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 
197 aa  82  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 
197 aa  74.7  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 
200 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  21.39 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 
203 aa  72  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  21.43 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0059  nucleoid occlusion protein  25.44 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0445493  normal  0.11202 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  24.53 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2985  nucleoid occlusion protein  30.69 
 
 
205 aa  63.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0459  nucleoid occlusion protein  25.31 
 
 
197 aa  63.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126678  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0194  nucleoid occlusion protein  25.16 
 
 
196 aa  63.2  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  24.53 
 
 
196 aa  63.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  25.15 
 
 
196 aa  62  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000410739  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3302  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 
215 aa  62  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.696216 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
203 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0373  nucleoid occlusion protein  24.1 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0485263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0385  nucleoid occlusion protein  24.1 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000224895  hitchhiker  0.00861349 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0399  nucleoid occlusion protein  24.1 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0627309  hitchhiker  0.000000000130483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0374  nucleoid occlusion protein  24.1 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2389  nucleoid occlusion protein  27.82 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.102395  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  27.72 
 
 
197 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000140669 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00047  nucleoid occlusion protein  28.16 
 
 
195 aa  60.1  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4251  nucleoid occlusion protein  24.1 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0044  nucleoid occlusion protein  26.73 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00442405  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3600  nucleoid occlusion protein  24.1 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.741133  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0356  nucleoid occlusion protein  24.1 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4564  nucleoid occlusion protein  33.33 
 
 
197 aa  60.1  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000269162  unclonable  0.0000000294752 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0181  nucleoid occlusion protein  25.75 
 
 
198 aa  59.3  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3674  nucleoid occlusion protein  24.84 
 
 
199 aa  59.3  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00408157  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4393  nucleoid occlusion protein  30.69 
 
 
198 aa  58.9  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000163426  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4103  nucleoid occlusion protein  30.69 
 
 
198 aa  58.9  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0313607  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3840  nucleoid occlusion protein  26.06 
 
 
197 aa  58.5  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00664895  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3831  nucleoid occlusion protein  23.95 
 
 
197 aa  58.5  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3773  nucleoid occlusion protein  24.71 
 
 
197 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.461125 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0052  nucleoid occlusion protein  30.69 
 
 
198 aa  58.2  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.881528  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0058  nucleoid occlusion protein  30.69 
 
 
198 aa  58.2  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00579463  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4158  nucleoid occlusion protein  30.69 
 
 
198 aa  58.2  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000407134  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4845  nucleoid occlusion protein  29.7 
 
 
198 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111456  decreased coverage  0.000000677674 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
181 aa  57.4  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1117  nucleoid occlusion protein  21.69 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.862438  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0324  nucleoid occlusion protein  27.72 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3484  nucleoid occlusion protein  26.06 
 
 
197 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000984177  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  22.3 
 
 
195 aa  56.6  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1012  hypothetical protein  28.12 
 
 
194 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0155  nucleoid occlusion protein  28.71 
 
 
198 aa  55.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.894699  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 
208 aa  55.5  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  24.83 
 
 
219 aa  55.8  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 
198 aa  55.5  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3963  nucleoid occlusion protein  28.71 
 
 
198 aa  55.5  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000172432  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0182  nucleoid occlusion protein  22.63 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847466  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  32.82 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0323  nucleoid occlusion protein  22.36 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000549659  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0111  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00780937  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0382  nucleoid occlusion protein  31.31 
 
 
197 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000135011  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3931  nucleoid occlusion protein  31.25 
 
 
198 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0886736  hitchhiker  0.000487739 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4119  nucleoid occlusion protein  31.25 
 
 
198 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441328  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3949  nucleoid occlusion protein  31.25 
 
 
198 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4058  nucleoid occlusion protein  31.25 
 
 
198 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3502  nucleoid occlusion protein  25.45 
 
 
195 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.284468  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4012  nucleoid occlusion protein  31.25 
 
 
198 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.554445  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0098  nucleoid occlusion protein  32.5 
 
 
198 aa  53.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0100985  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 
204 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0064  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
198 aa  52  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000175826  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3976  nucleoid occlusion protein  31.25 
 
 
198 aa  52  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.027184  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4142  nucleoid occlusion protein  31.25 
 
 
198 aa  52  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000526151  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3850  nucleoid occlusion protein  31.25 
 
 
198 aa  52  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>