293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1926 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  407  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 202 aa  230  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 202 aa  229  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 202 aa  229  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 202 aa  229  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  52.26 
 
 		 202 aa  226  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 202 aa  223  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  55.5 
 
 		 202 aa  219  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 202 aa  214  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1915  transcriptional regulator, TetR family  55.9 
 
 		 200 aa  202  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  45.55 
 
 		 199 aa  194  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1240  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1307  transcriptional regulator, TetR family  52.53 
 
 		 202 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  43.5 
 
 		 203 aa  184  6e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  52.53 
 
 		 202 aa  174  7e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 201 aa  174  7e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  148  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1362  TetR family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 139 aa  141  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3622  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 236 aa  134  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3254  TetR family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2838  hypothetical protein  38.46 
 
 		 186 aa  101  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209272 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 199 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 196 aa  89.4  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3302  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.696216 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2389  nucleoid occlusion protein  33.94 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.102395  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3007  nucleoid occlusion protein  33.33 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.8305 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  28.28 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000140669 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6449  nucleoid occlusion protein  26.63 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3114  nucleoid occlusion protein  29.38 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2484  nucleoid occlusion protein  32.69 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.11022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3098  nucleoid occlusion protein  32.69 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170288  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00047  nucleoid occlusion protein  22.7 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1117  nucleoid occlusion protein  24.67 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.862438  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3521  nucleoid occlusion protein  23.98 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3674  nucleoid occlusion protein  29.27 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00408157  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0044  nucleoid occlusion protein  24.63 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00442405  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0194  nucleoid occlusion protein  24.18 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2012  nucleoid occlusion protein  27.12 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  23.12 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1012  hypothetical protein  31.15 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3145  nucleoid occlusion protein  31 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0385  nucleoid occlusion protein  25.5 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000224895  hitchhiker  0.00861349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0374  nucleoid occlusion protein  25.5 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0373  nucleoid occlusion protein  25.5 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0485263  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1729  nucleoid occlusion protein  27.12 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4564  nucleoid occlusion protein  25.5 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000269162  unclonable  0.0000000294752 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3094  nucleoid occlusion protein  27.45 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.483047 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0459  nucleoid occlusion protein  23.17 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126678  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0324  nucleoid occlusion protein  26.35 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0399  nucleoid occlusion protein  25.5 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0627309  hitchhiker  0.000000000130483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4602  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.904797 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0378  nucleoid occlusion protein  30.77 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.99909  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4387  nucleoid occlusion protein  25.69 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.449333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0059  nucleoid occlusion protein  23.76 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0445493  normal  0.11202 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4251  nucleoid occlusion protein  25 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0183  nucleoid occlusion protein  30.77 
 
 		 229 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.24476  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3773  nucleoid occlusion protein  25 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.461125 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0193  nucleoid occlusion protein  30.77 
 
 		 229 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3247  nucleoid occlusion protein  30.77 
 
 		 229 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0182  nucleoid occlusion protein  29.63 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847466  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0542  nucleoid occlusion protein  24.11 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  22.78 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000410739  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3600  nucleoid occlusion protein  25 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.741133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3440  nucleoid occlusion protein  30.77 
 
 		 229 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0356  nucleoid occlusion protein  25 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0501  nucleoid occlusion protein  22.7 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.957497  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2181  nucleoid occlusion protein  30.77 
 
 		 229 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2908  nucleoid occlusion protein  30.77 
 
 		 229 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.946505  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0627  nucleoid occlusion protein  23.14 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.375777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0158  nucleoid occlusion protein  30.77 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  21.92 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3831  nucleoid occlusion protein  25.69 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 238 aa  52  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0336  nucleoid occlusion protein  24.77 
 
 		 227 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3979  nucleoid occlusion protein  23.49 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0062  nucleoid occlusion protein  25.69 
 
 		 232 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  23.73 
 
 		 198 aa  51.6  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0142  nucleoid occlusion protein  27.34 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0382  nucleoid occlusion protein  24.83 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000135011  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>