More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3361 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  470  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  73.8 
 
 		 234 aa  339  2.9999999999999998e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1468  TetR family transcriptional regulator  66.94 
 
 		 260 aa  321  8e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  63.44 
 
 		 248 aa  295  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  63.44 
 
 		 248 aa  295  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  63 
 
 		 248 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  63.39 
 
 		 258 aa  292  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  63.68 
 
 		 240 aa  291  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  63.39 
 
 		 254 aa  291  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  63.39 
 
 		 254 aa  291  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  63.39 
 
 		 254 aa  291  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  63.39 
 
 		 254 aa  291  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  63.39 
 
 		 254 aa  291  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  63.39 
 
 		 254 aa  291  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  63.39 
 
 		 254 aa  291  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0611  TetR family transcriptional regulator  68.18 
 
 		 248 aa  290  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  63.23 
 
 		 248 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  61.33 
 
 		 248 aa  289  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  62.78 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  64.55 
 
 		 254 aa  286  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  62.39 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  62.56 
 
 		 259 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 234 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  24.23 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  22.99 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  22.99 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  22.99 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  22.99 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  22.99 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  23.26 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 205 aa  62  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  20.38 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  22.8 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  25.39 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  24.51 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  21.51 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  25.52 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  29.09 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  22.44 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 202 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  24.35 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 193 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 198 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2164  regulatory protein, TetR  30.3 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>