More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3341 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  77.84 
 
 		 195 aa  299  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 202 aa  141  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  43.96 
 
 		 196 aa  134  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 205 aa  124  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  38.62 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  37.43 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  36.55 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  38.14 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 200 aa  111  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 209 aa  107  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  35.36 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 216 aa  104  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 199 aa  98.2  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 229 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  33.89 
 
 		 214 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 214 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 189 aa  91.7  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  30.99 
 
 		 219 aa  91.3  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  27.96 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 218 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 197 aa  84.7  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1940  AcrR family transcriptional regulator  31 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.682868  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  31.22 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  39.76 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 195 aa  72  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 248 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 248 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 259 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 248 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  30.52 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02513  transcriptional regulator, TetR family protein  33.6 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  40.32 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>