More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1436 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  78.23 
 
 		 206 aa  209  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  78.23 
 
 		 206 aa  198  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35 
 
 		 196 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  35.77 
 
 		 214 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 197 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 218 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0212  transcription regulator TetR/AcrR family protein  30.84 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  43.02 
 
 		 194 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 226 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  38.46 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 211 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 208 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 199 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  49.18 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 203 aa  57.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0509  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 251 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  43.1 
 
 		 260 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 203 aa  57.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 222 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 225 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 186 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  42.03 
 
 		 214 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 207 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 211 aa  57  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  49.28 
 
 		 225 aa  57  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  49.28 
 
 		 225 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  34.29 
 
 		 207 aa  57  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  42.25 
 
 		 212 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 230 aa  57  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 214 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  29.69 
 
 		 206 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 197 aa  57  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 214 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  42.11 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  29.31 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  45.28 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 346 aa  55.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2129  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0125  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.493759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>