More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0522 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  453  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4951  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 239 aa  205  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717286  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5643  TetR family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 224 aa  197  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240264  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3913  TetR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20842  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3163  transcriptional regulator, TetR family  46.19 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0951  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 242 aa  166  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2019  transcriptional regulator, TetR family  37.91 
 
 		 235 aa  158  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1292  regulatory protein TetR  40.1 
 
 		 231 aa  158  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1454  transcriptional regulator, TetR family  40.1 
 
 		 231 aa  158  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0553  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 233 aa  157  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  40.2 
 
 		 237 aa  157  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2950  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3728  TetR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4199  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.680761 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5853  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 230 aa  138  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161572 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0081  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0649  TetR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899851  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 198 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 309 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  38.16 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03459  hypothetical protein  41.43 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  52.4  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  30 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  46.38 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  31.48 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4995  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2619  HTH-type luminescence regulator LitR  38.36 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  26.45 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  30.14 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  37.14 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  41.18 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  21.08 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 273 aa  48.5  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 200 aa  48.9  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 187 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 204 aa  48.9  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 240 aa  48.9  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 187 aa  48.5  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 220 aa  48.5  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 231 aa  48.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0808  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 222 aa  48.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 194 aa  48.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  33.64 
 
 		 247 aa  48.1  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  34.62 
 
 		 210 aa  48.5  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 232 aa  48.5  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 406 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  27.2 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>