More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03459 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03459  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  428  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002553  quorum-sensing regulator of virulence HapR  95.08 
 
 		 183 aa  367  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2619  HTH-type luminescence regulator LitR  62 
 
 		 201 aa  271  5.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0115  hemagglutinin/protease regulatory protein  60.77 
 
 		 132 aa  185  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0116  hemagglutinin/protease regulatory protein  92.42 
 
 		 68 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2129  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  22.54 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1292  regulatory protein TetR  37.5 
 
 		 231 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  25.66 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1454  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 231 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4572  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2716  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0607966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2667  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.182644  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2644  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.773011  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  34.88 
 
 		 278 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2970  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.642297  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2924  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 388 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2923  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.30016e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2934  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  24.27 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2228  TetR family transcriptional regulator  20.37 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112072 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2963  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  23.91 
 
 		 251 aa  48.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  27.54 
 
 		 206 aa  48.1  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3573  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0355911  normal  0.084172 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  20.13 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  33.82 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2019  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  20.25 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1882  regulatory protein TetR  39.34 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  27.2 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  20.12 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2337  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000766652  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  24.22 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  22.09 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  29.07 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  21.92 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  21.53 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 198 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  23.81 
 
 		 189 aa  45.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 242 aa  45.4  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  21.53 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  20.12 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  24.2 
 
 		 221 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  25.45 
 
 		 237 aa  45.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>