More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1882 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1882  regulatory protein TetR  100 
 
 		 204 aa  411  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1210  transcriptional regulator, TetR family  34.98 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0313613  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0460  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 236 aa  121  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466873  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 230 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 209 aa  92  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8998  putative transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 229 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8733  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153176  normal  0.242309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32400  transcriptional regulator, tetR family  28.79 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 237 aa  62  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 330 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  28.69 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  27.83 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2619  HTH-type luminescence regulator LitR  28.37 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10480  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 234 aa  52  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 307 aa  51.6  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  24.7 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  23 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  27.19 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  24.07 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 317 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  25.81 
 
 		 278 aa  48.5  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 310 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 245 aa  48.5  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  23.53 
 
 		 256 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  29.63 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 220 aa  48.1  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2667  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.182644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2644  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.773011  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2924  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1794  transcriptional regulator  26.06 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2923  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.30016e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2934  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  34.17 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2970  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.642297  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0116  hemagglutinin/protease regulatory protein  43.64 
 
 		 68 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>